Martin Ortner wurde in Salzburg geboren und wuchs in Pilsbach bei Vöcklabruck auf. Derzeit lebt er wieder in Salzburg. Sein Studium im Fach klassisches Schlagwerk absolvierte er bei Prof. Gerhard Windbacher an der Universität für Musik und darstellende Kunst Wien, das er mit ausgezeichnetem Erfolg abschloss.

Im Sommer 2019 war Martin Ortner Mitglied der Angelika Prokopp Sommerakademie der Wiener Philharmoniker. In der Spielzeit 2019/20 war er als Pauker und Schlagwerker im Bruckner Orchester Linz engagiert. Darüber hinaus ist er regelmäßig als Substitut in renommierten Orchestern tätig, darunter das Orchester der Wiener Staatsoper, die Wiener Symphoniker, das ORF Radio-Symphonieorchester Wien, die Volksoper Wien, das Bruckner Orchester Linz, das Mozarteum Orchester Salzburg sowie die Grazer Philharmoniker. Auch in Deutschland trat er unter anderem mit dem Sinfonieorchester Wuppertal und den Bad Reichenhaller Philharmonikern auf.

Neben seiner klassischen Orchestertätigkeit widmet sich Martin Ortner mit großer Begeisterung der Blasmusik. Er ist Mitglied der Brass Band Oberösterreich sowie Gründer und Leiter der Formation „Brassaranka“. Zudem ist er mit den Gruppen Egeranka und Saturday Night Fiver regelmäßig in ganz Österreich zu erleben. Als Schlagzeuger ist er außerdem ein gern gesehener Gast bei der Kapelle Josef Menzl und den Obermüller Musikanten.

Neben seiner künstlerischen Tätigkeit ist Martin Ortner auch pädagogisch aktiv und unterrichtet Schlagwerk am oberösterreichischen Landesmusikschulwerk.